Учреждение Целевого капитала Некоммерческой организации (Эндаумент-Фонда) осуществляется путем сбора в его состав денежных средств пожертвователей (на сумму не менее 3 млн.руб.) и обособления этих средств путем передачи в доверительное управление. Необходимым условием учреждения Эндаумент-Фонда является формирование НКО-учредителем Совета по использованию целевого капитала.

После учреждения Эндаумент-Фонд может пополняться пожертвованиями в виде не только денежных средств, но и ценных бумаг, а также недвижимости.

Функционирование Эндаумент-Фонда представляет собой следующие процессы: 

• cбор пожертвований осуществляет НКО на основе индивидуальных или стандартизированных договоров дарения, а также по завещаниям (полученные пожертвования передаются в доверительное управление); 
  
  
• доверительное управление Эндаумент-Фондом осуществляет управляющая компания, которая инвестирует собранные НКО средства путем приобретения разрешенных активов и доход передает НКО-учредителю Эндаумент-Фонда; 
  
  
• распределение дохода от целевого капитала осуществляет НКО на цели, определенные жертвователями или Советом по использованию целевого капитала в соответствии Финансовым планом НКО (неспециализированная НКО использует доход самостоятельно; специализированная НКО передает его иным НКО-получателям дохода). 

Доход может быть использован НКО не полностью (однако размер неиспользованного дохода, не может быть более 50% такого дохода за два года подряд).

Таким образом, Эндаумент-Фонд обеспечивает финансирование некоммерческой деятельности НКО-собственника целевого капитала или иных НКО.

Контроль за Эндаумент-Фондом осуществляется с различных сторон. НКО-учредитель обязана раскрывать информацию жертвователям о целевом капитале и его использовании. 

Управляющая компания формирует отчетность об управлении Эндаумент-Фондом для НКО-учредителя. Кроме того за деятельностью управляющих компаний осуществляется государственный надзор в лице Банка России, лицензирующего их деятельность.

Также, управляющие компании, НКО и получатели дохода в определенных законом случаях подлежат обязательному ежегодному аудиту.